石門水庫於民國52年建壩蓄水營運以來，歷經41年至民國92年止，水庫累積淤積量約達5,600萬立方公尺，佔水庫蓄水量18%，自民國88年「921地震」後，水庫集水區上游多處山坡地土石多處鬆動、崩塌，加上連續兩年之乾旱，今年又遭逢艾利颱風豪雨侵襲，使得約有2,000萬立方公尺泥砂運移入庫，淤積面幾乎掩埋標高195公尺石門大圳取水口，另標高200公尺以下原水濁度更高達10萬度以上，使得南桃園地區無法正常供水。

據此水利署北區水資源局正積極地籌辦各項計畫，期以達成減淤成效，並活化水庫再造石門勝景為當下目標，其做法將於水庫增設取水工程，該局計畫於水庫左壩墩增設取水設施，供颱風、豪雨、洪水來襲導致水庫原水渾濁時，直接抽取水庫約標高220公尺較上層原水，銜接自來水輸水管線將原水輸送至淨水場，以確保大桃園地區民生用水供應穩定，該工程將於94年2月施工至94年9月完工；另再置設第二後池工程，於水庫下游1,500公尺蓄水庫範圍增設第二後池，於豐水期蓄滿水量約500萬立方公尺作為備用水源，每年將可增加約2,500萬立方公尺水量，並於颱風期間先行沉澱原水，降低濁度，供下游板新水廠及平鎮第二抽水站供需民生用水，並於枯水期提供休閒及遊憩使用，該工程預計94年10月動工，99年12月完工，並將徵收大溪榮安二村用地，以避免洩洪危及該村人員生命財產安全。

同時於水庫增設排砂設施工程倘遭颱風、豪雨、洪水時，配合水庫年平均淤積量285萬立方公尺，由排砂道將水庫異重流直接排入下游河道，減少水庫淤積，並可供給下游河道必要之砂源以平衡河道沖淤，並避免下游跨河構造物損壞，該項工程於94年12月啟動預計99年12月完成，另將規劃濱海地區填海造陸之砂源，使物盡其用減少及避免二次污染；另於水庫上游增設攔砂壩工程，有鑑於艾利颱風過境後，豪雨沖蝕造成石門水庫集水區大量土石之崩塌，將大漢溪上游各主流攔砂壩淤滿，為防止颱風豪雨沖蝕重蹈覆轍，乃規劃於大漢溪主、支流河道適當地點，再增設中小型攔砂壩，以延長水庫壽命，該項工程於94年6月開始施作，預計98年12月完工